A l'origine, Thann est un simple hameau dépendant de Vieux-Thann et du comté de Ferrette. Le site prospère en devenant lieu de pèlerinage vers 1160 suite au miracle de Thiébaud Comme le village se situe sur une voie de passage entre Lombardie et Flandres, Frédéric II de Ferrette y établit un péage qu'il protège par un château, l'Engelsbourg. Contestée un moment par l'évêque de Strasbourg, la position reste aux Ferrette et le comte Thiébaud développe la cité: elle devient ville fortifiée en 1304. A partir de 1287 une collégiale Saint Thiébaud est édifiée, et les Franciscains installent dans les faubourgs un couvent dans lequel est inhumé en 1324 le dernier des comtes de Ferrette, Ulric III.
Par héritage, Thann passe aux Habsbourg; une première extension et réalisée en 1360, une seconde en 1387, prouvant la richesse de la cité, basée sur le péage, le commerce, le vignoble et surtout le pèlerinage. L'administration de la cité est confiée à un conseil de bourgeois. Les Suisses, en guerre avec les Habsbourg, détruisent le faubourg en 1468. L'année suivante, Thann est gagée au Téméraire. Le bailli Pierre de Hagenbach lève aussitôt une taxe sur le vin. C'est la révolte et la répression immédiate: quatre des bourgeois meneurs sont exécutés en 1472. La ville est délivrée du Téméraire en 1474 et son expansion se poursuit, marquée par la pose de la flèche de la collégiale en 1478.
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